ทำไม NGS ถึงดีกว่าแซงเจอร์?
ทำไม NGS ถึงดีกว่าแซงเจอร์?
Anonim

ขนาดตัวอย่าง

NGS มีราคาถูกลง เร็วขึ้น ต้องการ DNA น้อยลงอย่างมากและมีค่า มากกว่า ถูกต้องและเชื่อถือได้ กว่าแซงเงอร์ ลำดับ มาดูกันเลย มากกว่า อย่างใกล้ชิด. สำหรับ แซงเกอร์ จำเป็นต้องมี templateDNA จำนวนมากสำหรับการอ่านแต่ละครั้ง

ผู้คนยังถามว่า ข้อดีของการจัดลำดับรุ่นต่อไปคืออะไร?

แต่ละคนมีความเฉพาะเจาะจง ข้อดี สำหรับเกณฑ์: ความยาวในการอ่าน ความแม่นยำ เวลาทำงาน และปริมาณงาน นอกจากการวิเคราะห์ลำดับดีเอ็นเอแล้ว ความก้าวหน้าของ ลำดับ เทคโนโลยีมีผลในการวิเคราะห์องค์ประกอบทางชีววิทยาอื่นๆ เช่น RNA และโปรตีน เช่นเดียวกับวิธีที่พวกมันโต้ตอบกันในเครือข่ายเซลลูลาร์ที่ซับซ้อน

อาจมีคนถามอีกว่าเหตุใดการเรียงลำดับ Sanger จึงยังคงใช้อยู่ ลำดับแซงเจอร์ ดีขึ้นในช่วงหลายปีที่ผ่านมา โดยส่วนใหญ่เกิดจากระบบอัตโนมัติ และเป็นพื้นฐานสำหรับ ลำดับ จีโนมมนุษย์ตัวแรกในปี 2000 อย่างไรก็ตาม ภายในเวลาไม่ถึงสองทศวรรษ NGS ก็ได้แซงหน้า ลำดับแซงเจอร์ เนื่องจากปริมาณงานสูง การทำงานแบบขนาน และต้นทุนต่อเบสที่ต่ำกว่ามาก

ดังนั้น อะไรคือความแตกต่างระหว่างการจัดลำดับ Sanger และการจัดลำดับรุ่นต่อไป?

นิวคลีโอไทด์ที่ถูกรวมเข้าแต่ละตัวจะถูกระบุโดยแท็กเรืองแสง ที่สำคัญ ความแตกต่างระหว่าง Sangersequencing และ NGS คือ ลำดับ ปริมาณ. ในขณะที่ แซงเกอร์ วิธีเท่านั้น ลำดับ ชิ้นส่วน DNA ทีละชิ้น NGS ขนานกันอย่างหนาแน่น ลำดับ ล้านชิ้นส่วนพร้อมกันต่อการรัน

การจัดลำดับ Sanger มีความแม่นยำเพียงใด?

ลำดับแซงเจอร์ ด้วย 99.99% ความแม่นยำ คือ “มาตรฐานทองคำ” สำหรับการวิจัยทางคลินิก ลำดับ . อย่างไรก็ตาม เทคโนโลยี NGS ที่ใหม่กว่าก็กลายเป็นเรื่องธรรมดาในห้องปฏิบัติการวิจัยทางคลินิกด้วยเนื่องจากความสามารถในการรับส่งข้อมูลที่สูงขึ้นและต้นทุนต่อตัวอย่างที่ต่ำลง

แนะนำ: