วีดีโอ: อะไรคือความแตกต่างระหว่างการจัดลำดับ Sanger และการจัดลำดับรุ่นต่อไป?
2024 ผู้เขียน: Stanley Ellington | [email protected]. แก้ไขล่าสุด: 2023-12-16 00:24
ต่อไป - ลำดับรุ่น (NGS)เทคโนโลยีมีความคล้ายคลึงกัน ที่สำคัญ ความแตกต่างระหว่าง Sangersequencing และ NGS คือ ลำดับ ปริมาณ. ในขณะที่ แซงเกอร์ วิธีเท่านั้น ลำดับ ชิ้นส่วน DNA ทีละชิ้น NGS ขนานกันอย่างหนาแน่น ลำดับ ล้านชิ้นส่วนพร้อมกันต่อการรัน
นอกจากนี้ การจัดลำดับรุ่นต่อไปทำงานอย่างไร
หลักการเบื้องหลัง ลำดับรุ่นต่อไป (NGS) คล้ายกับของแซงเงอร์ ลำดับ ซึ่งอาศัยอิเล็กโตรโฟรีซิสของเส้นเลือดฝอย สายพันธุกรรมถูกแยกส่วน และฐานในแต่ละส่วนถูกระบุโดยสัญญาณที่ปล่อยออกมาเมื่อชิ้นส่วนถูกผูกติดกับสายแม่แบบ
ในทำนองเดียวกัน ทำไม NGS ถึงดีกว่าแซงเจอร์ NGS มีราคาถูกลง เร็วขึ้น ต้องการ DNA น้อยลงอย่างมากและมีค่า มากกว่า ถูกต้องและเชื่อถือได้ กว่าแซงเงอร์ ลำดับ มาดูกันเลย มากกว่า อย่างใกล้ชิด. สำหรับ แซงเกอร์ จำเป็นต้องมี templateDNA จำนวนมากสำหรับการอ่านแต่ละครั้ง
ด้วยวิธีนี้ การจัดลำดับรุ่นต่อๆ ไปหมายถึงอะไร?
ลำดับรุ่นต่อไป (NGS, NextGenSeq) คือ ใหม่ วิธีการ ลำดับ จีโนมที่ความเร็วสูงและต้นทุนต่ำ เป็นที่รู้จักกันว่า ลำดับรุ่นที่สอง (SGS) หรือขนานกันอย่างหนาแน่น ลำดับ (MPS)การทดสอบลำดับดีเอ็นเอของไมโตคอนเดรียจาก FTDNA ก็ใช้ ลำดับรุ่นต่อไป เทคโนโลยี.
การจัดลำดับรุ่นต่อไปแตกต่างจากการจัดลำดับแบบเดิมอย่างไร
ตามแนวคิดหลัก ความแตกต่าง ระหว่าง ลำดับรุ่นต่อไป และอื่น ๆ การเรียงลำดับแบบดั้งเดิม วิธีการเช่น Sanger ลำดับคือ นั่น รุ่นต่อไปคือ สามารถ ลำดับ นิวคลีโอไทด์จำนวนมากขึ้นในการวิ่งครั้งเดียว แนวคิดที่เราเรียกว่าผลผลิตสูง
แนะนำ:
การจัดลำดับ DNA ของ Sanger ทำงานอย่างไร
การจัดลำดับแซงเจอร์ส่งผลให้เกิดผลิตภัณฑ์ส่วนขยายที่มีความยาวต่างๆ ที่สิ้นสุดด้วยไดดีออกซีนิวคลีโอไทด์ที่ปลาย 3' ผลิตภัณฑ์ต่อขยายจะถูกคั่นด้วย Capillary Electrophoresis หรือ CE โมเลกุลถูกฉีดโดยกระแสไฟฟ้าเข้าไปในเส้นเลือดฝอยแก้วยาวที่เต็มไปด้วยเจลโพลีเมอร์
เหตุใดเราจึงใช้การจัดลำดับ Sanger
การจัดลำดับ Sanger เป็นแนวทางที่มีประสิทธิภาพสำหรับการศึกษาการคัดกรองแบบแปรผันเมื่อจำนวนตัวอย่างทั้งหมดต่ำ สำหรับการศึกษาการคัดกรองตัวแปรที่จำนวนตัวอย่างสูง การจัดลำดับแอมพลิคอนด้วย NGS จะมีประสิทธิภาพและคุ้มทุนมากกว่า
การจัดลำดับ Sanger มีความแม่นยำเพียงใด?
การจัดลำดับแซงเจอร์ด้วยความแม่นยำ 99.99% เป็น “มาตรฐานทองคำ” สำหรับการจัดลำดับการวิจัยทางคลินิก อย่างไรก็ตาม เทคโนโลยี NGS ที่ใหม่กว่าก็กลายเป็นเรื่องธรรมดาในห้องปฏิบัติการวิจัยทางคลินิกเนื่องจากความสามารถในการรับส่งข้อมูลที่สูงขึ้นและต้นทุนต่อตัวอย่างที่ต่ำลง